《河北工程大学学报(自然科学版)》（季刊）创刊于1984年，当时刊名为《河北煤炭建筑工程学院学报》。1991年经国家科委和新闻出版署批准成为公开发行刊物。1997年正式更名为《河北建筑科技学院学报》。1998正式成为科技部中国科技论文统计源期刊，同年成为中国学术期刊（光盘版）全文收录期刊。1999年被美国化学文摘－chemicalabstract（CA）收录。2000年成为中国科学引文数据库源刊、中国学术期刊综合评价数据库源刊。2001年被万方数据库全文收录。2001年9月全文被《中文科技期刊数据库》收录。2003年1月被《中国核心期刊（遴选）数据库》收录，同时被中国学术期刊（光盘版）电子杂志社评为第三批执行《CAJ-CD规范》优秀期刊，同年3月被俄罗斯《文摘杂志》（PЖ）确定为定期收录期刊。2006年8月经新闻出版总署批准，更名为《河北工程大学学报(自然科学版)》。